世界遺産の中で関西の神社だけで見ると文化遺産で「古都京都の文化財」（京都・平成6年記載）、「古都奈良の文化財」（奈良・平成10年記載）、「紀伊山地の霊場と参詣道」（三重県・奈良県・和歌山県・平成16年記載）が選ばれています。
※「紀伊山地の霊場と参詣道」は文化遺産の中の文化的景観として
この3つの中で城、寺院（お寺）、とあわせて神社も含まれています。
世界遺産に登録されている関西の神社をまとめてみました。
「古都京都の文化財」の神社（京都府）
「古都京都の文化財」が1994年（平成6年）に世界遺産の文化遺産に記載されました。
「古都京都の文化財」で選ばれた神社は3社。
| 世界遺産の神社（京都） | 読み方 | 住所 |
| 賀茂別雷神社（上賀茂神社） | かもわけいかづちじんじゃ（かみがもじんじゃ） | 京都市北区上賀茂本山 |
| 賀茂御祖神社（下鴨神社） | かもみおやじんじゃ（しもがもじんじゃ） | 京都市左京区下鴨泉川町 |
| 宇治上神社 | うじがみじんじゃ | 京都府宇治市宇治山田 |
神社以外では、教王護国寺（東寺）、清水寺、延暦寺、仁和寺、平等院、高山寺、西方寺（苔寺）、天龍寺、鹿苑寺（金閣寺）、慈照寺（銀閣寺）、龍安寺、本願寺、二条城の合計17件。
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「古都奈良の文化財」の神社（奈良県）
「古都京都の文化財」が1998年（平成10年）に世界遺産の文化遺産に記載されました。
「古都京都の文化財」で選ばれた神社は1社。
| 世界遺産の神社（奈良県） | 読み方 | 住所 |
| 春日大社 | かすがたいしゃ | 奈良県奈良市春日野町 |
神社以外では、東大寺、興福寺、元興寺、薬師寺、唐招提寺、平城京跡、春日山原始林。
「紀伊山地の霊場と参詣道」の神社（三重県・奈良県・和歌山県）
「紀伊山地の霊場と参詣道」が2004年（平成16年）に世界遺産の文化遺産「文化的景観」に記載されました。
紀伊山地は和歌山県・奈良県・三重県にまたがる霊場です。
| 世界遺産の神社（京都） | 登録資産エリア | 住所 |
| 熊野本宮大社 | 熊野三山 | 和歌山県田辺市 |
| 熊野速玉大社 | 熊野三山 | 和歌山県新宮市 三重県南牟婁郡紀宝町 |
| 熊野那智大社 | 吉野・大峯 | 和歌山県東牟婁郡那智勝浦町 |
| 吉野水分神社 | 吉野・大峯 | 奈良県吉野郡吉野町 |
| 金峯神社 | 吉野・大峯 | 奈良県吉野郡吉野町 |
| 吉水神社 | 吉野・大峯 | 奈良県吉野郡吉野町 |
| 丹生都比売神社 | 高野山 | 和歌山県伊都郡かつらぎ町 |
| 丹生官省符神社 | 高野山 | 和歌山県伊都郡九度山町 |
| 闘鶏神社※ | 参詣道 | 和歌山県田辺市東陽 |
※闘鶏神社は2016年（平成28年）に追加登録されました。